В Институте базируются три Диссертационных совета ВАК, рассматривающие ежемесячно и принимающие к защите несколько диссертационных работ на соискание ученой степени доктора или кандидата наук по 6 специальностям:

02.00.04 – Физическая химия по химическим и физико-математическим наукам

02.00.05 – Электрохимия

02.00.09 – Химия высоких энергий

02.00.11 – Коллоидная химия

02.00.14 – Радиохимия

05.17.03 – Технология электрохимических процессов и защита от коррозии

В соответствии с общими принципами «Положения ВАК РФ о совете по защите докторских и кандидатских диссертаций» по решению Высшей аттестационной комиссии РФ в установленном порядке при Учреждении Российской академии наук Институте физической химии и электрохимии им. А.Н.Фрумкина РАН создано на срок действия Номенклатуры специальностей (Приказ Минобрнауки РФ от 25.02.2009 N 59 (ред. от 16.11.2009) “Об утверждении Номенклатуры специальностей научных работников” (Зарегистрировано в Минюсте РФ 20.03.2009 N 13561) три диссертационных совета, соответствующих научной и научно-педагогической деятельности Института.